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4D-泛素化修饰蛋白质组学

4D-泛素化修饰蛋白质组学

蛋白泛素化修饰(Ubiquitination)常伴随泛素-蛋白酶体降解,引起蛋白稳定性变化,参与增殖凋亡、内吞、免疫等各种生物调控过程。其发生过程是通过一个三酶级联 (E1-E2-E3)反应,使得单或多个泛素分子连接到蛋白氨基酸(Lys)侧...

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蛋白泛素化修饰(Ubiquitination)常伴随泛素-蛋白酶体降解,引起蛋白稳定性变化,参与增殖凋亡、内吞、免疫等各种生物调控过程。其发生过程是通过一个三酶级联 (E1-E2-E3)反应,使得单或多个泛素分子连接到蛋白氨基酸(Lys)侧链上,并常伴随蛋白酶体降解,调控蛋白表达水平变化。发生泛素化修饰的赖氨酸共价连接泛素分子,即两个甘氨酸K-ε-GG残基,使分子量产生114.1 Da的质量偏移。利用质谱可精确测定分子量是否发生114.1Da的质量偏移,从而检测泛素化修饰肽段及位点。 4D-label free泛素化蛋白组学是基于新一代timsTOF Pro质谱仪,通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂(ddaPASEF)扫描模式进行泛素化差异蛋白质组学分析。4D-label free修饰组,利用了离子淌度分离,能根据分子的形状、截面积属性,可有效区分修饰同分异构多肽,极大提高修饰的鉴定深度,以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。






实验流程:
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应用方向:

 药理药靶、基因敲除/过表达的修饰表达分析;


 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究;


 细胞自噬、细胞周期、衰老等信号通路;


 疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析;


 神经及退行性疾病、肿瘤发病机制等机制研究;


 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选。




推荐组合产品:蛋白表达水平全面解析:转录组+蛋白组+泛素化组。






技术优势:

 4D技术加持,提高定量的准确性、鉴定深度,更加适合微量样本;


 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制,灵活方便;


 前沿技术——基于新一代质谱平台(Bruker timsTOF pro),检测速度提升近一倍;


 经验丰富——超16年蛋白平台服务经验,拥有数量与质量领先的高水平项目文章;


 数据保证——采用进口金标抗体,高标准修饰富集操作,数据结果稳定可靠;


 系统解决方案——提供修饰组学至验证、上下游联合分析,实现快捷”一站式”服务。




推荐组合产品:蛋白表达水平全面解析:转录组+蛋白组+泛素化组。






据分析:


标准数据分析内容

蛋白质总鉴定数量分析

蛋白鉴定与定量结果统计、韦恩图分析、差异结果数量统计、火山图、聚类热图

差异蛋白质功能分析

亚细胞定位、结构域分析、motif分析、GO功能分析、KEGG通路分析、互作网络分析

质量控制分析

肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布

高级数据分析内容

WGCNA共表达分析

获得与表型强关联的核心蛋白质

趋势聚类分析

探讨蛋白质的表达趋势模式