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定量糖基化蛋白质组学

定量糖基化蛋白质组学

糖基化是指蛋白质在酶的作用下被连接上糖链的过程。细胞内超过 50% 的蛋白质都修饰有糖链。连接于天冬酰胺(Asn)残基上的N-糖基化在真核生物中广为存在,也是研究最为深入的一种糖基化形式。蛋白质N-糖基化修饰主要在复杂的多细胞或组织形成过程...

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糖基化是指蛋白质在酶的作用下被连接上糖链的过程。细胞内超过 50% 的蛋白质都修饰有糖链。连接于天冬酰胺(Asn)残基上的N-糖基化在真核生物中广为存在,也是研究最为深入的一种糖基化形式。蛋白质N-糖基化修饰主要在复杂的多细胞或组织形成过程中起关键作用,参与细胞识别、免疫应答、细胞分化等生命活动。 蛋白质经酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,再用N-糖酰胺酶(PNGase)在重水中切除糖链,然后通过LC-MS/MS对糖基化位点进行分析,实现大规模N-糖基化蛋白质定性定量分析。








实验流程:
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技术优势:

 鉴定通量高,一次最高可检测上万个N-糖基化修饰位点;


 上万篇文献见证;


 多组学分析:可联合代谢组学进行机制+表型方向的研究。








应用方向:

生物领域各个研究方面,如:


 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;


 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;


 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等。








据分析:




蛋白质鉴定列表

层次聚类热图(cluster)

COG/KOG分析

肽段鉴定定量列表

修饰位点统计绘图

GO富集分析

修饰位点鉴定定量列表

GO功能富集图

KEGG富集分析

肽段保守motif分析列表

KEGG通路图

蛋白质互作网络分析

GO功能列表

保守motif分析

互作网络Module分析

KEGG信号通路Mapping表

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