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Label free 蛋白质组
Label free是一种不依赖于同位素标记的非标记蛋白组定量技术，通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内标，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对...
Label free是一种不依赖于同位素标记的非标记蛋白组定量技术，通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内标，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
实验流程：
技术优势：
◆ 无需昂贵的同位素标记试剂，实验周期短；
◆ 可用于不同物种间的“有无差异蛋白”比较；
◆ 克服标记定量技术在样本数量的上限制，灵活方便。
应用方向：
生物领域各个研究方面，如：
◆ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；
◆ 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；
◆ 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；
◆ 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等。
数据分析：
| 标准数据分析内容 | |
蛋白质总鉴定数量分析 | 蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图 |
差异蛋白质功能分析 | 亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析 |
| 质量控制分析 | 肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
高级数据分析内容 | |
WGCNA共表达分析 | 获得与表型强关联的核心蛋白质 |
| 趋势聚类分析 | 探讨蛋白质的表达趋势模式 |
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